Si tienes varias máquinas, asegúrate de espaciar el comando Unattended-Upgrade::Automatic-Reboot-Time para que no se reinicien todas al mismo tiempo.
Las actualizaciones de seguridad automáticas son útiles cuando no puedes acceder a tu máquina pero deseas que las actualizaciones de seguridad críticas se apliquen automáticamente.
APT::Periodic::Update-Package-Lists "1";
APT::Periodic::Unattended-Upgrade "1"
APT::Periodic::AutocleanInterval "7";
Unattended-Upgrade::Remove-Unused-Dependencies "true";
Unattended-Upgrade::Remove-New-Unused-Dependencies "true";
# Esta es la opción más importante: el reinicio automático.
# Esto debería estar bien, ya que todos los servicios deberían
# iniciarse automáticamente al reiniciar.
Unattended-Upgrade::Automatic-Reboot "true";
Unattended-Upgrade::Automatic-Reboot-Time "02:00";